Kostel Thomaskirche je místem bohoslužeb, hudby, domovem chlapeckého pěveckého sboru svatého Tomáše a místem posledního odpočinku Johanna Sebastiana Bacha.
Zde vznikla většina Bachových děl . Kostel Thomaskirche je také místem Bachova posledního odpočinku a je považován za významné centrum klasické hudby i daleko za hranicemi Německa.
Zvláštním bodem programu jsou týdenní moteta v pátek v 18 hodin (v liturgické formě nešpor, délka trvání cca 1 hodina) a v sobotu v 15.00 (obvykle s provedením kantáty Johanna Sebastiana Bacha). Moteta zpravidla provádí lipský tomášský sbor, v případě jeho nepřítomnosti sbor zastupují hostující soubory nebo hostující varhaníci. Program pro moteta je k dispozici u vchodů do kostela Thomaskirche přibližně 45 minut před začátkem. Předprodej vstupenek není možný.
