In 1212 werd de Thomaskirche gebouwd als kloosterkerk. Het kijkt terug op een geschiedenis van ruim 800 jaar. 27 jaar lang was de kerk de werkplaats van Johann Sebastian Bach, die van 1723 tot 1750 St. Thomascantor in Leipzig was. Gedurende deze tijd leidde hij het St. Thomas Choir, dat vandaag de dag nog steeds internationale bekendheid geniet. Bovendien werd in deze periode een groot deel van Bachs werken geschreven.
De Thomaskirche is de laatste rustplaats van Bach en wordt beschouwd als een belangrijk centrum van klassieke muziek - tot ver buiten de grenzen van Duitsland.
Een bijzonder hoogtepunt zijn de wekelijkse motetten, elke vrijdag om 18.00 uur (in de liturgische vorm van vespers, die ongeveer 1 uur duren) en zaterdag om 15.00 uur (meestal met uitvoering van een cantate van Johann Sebastian Bach). De motetten worden doorgaans uitgevoerd door het Thomanerchor Leipzig; bij afwezigheid vertegenwoordigen gastensembles of gastorganisten het koor. Het instapprogramma voor het motet kun je 45 minuten voor aanvang kopen bij de ingangen van de Sint-Thomaskerk. Er is geen voorverkoop van kaartjes mogelijk.